neuroConstruct 1.6.0

neuroConstruct is being developed in the Silver Lab in the Department of Neuroscience, Physiology and Pharmacology at UCL. neuroConstruct has been designed to simplify development of complex networks of biologically realistic neurons, i.e. models incorporating dendritic morphologies and realistic cell membrane conductances. It is implemented in Java and generates script files for the NEURON and GENESIS simulators, with support for other simulation platforms (including PSICS, MOOSE and PyNN) in advanced stages of development. It uses the latest NeuroML specifications, including MorphML, ChannelML and NetworkML.

Development of this software was made possible with funding from the Wellcome Trust, the Medical Research Council and the EU Synapse Project.

Some of the key features of neuroConstruct are:

* neuroConstruct can import morphology files in GENESIS, NEURON, Neurolucida, SWC and MorphML format for inclusion in single cell or network models, or more abstract cells can also be built manually.
* Creation of networks of conductance based neurons positioned in 3D
* Complex connectivity patterns between cell groups can be specified for the networks
* Simulation scripts can be generated for NEURON, GENESIS, MOOSE, PSICS and PyNN based simulators (note: not every project can be generated for every simulator)
* Biophysically realistic cellular mechanisms (synapses/channel mechanisms) can be imported from native script files (*.mod or *.g) or created from templates using ChannelML
* Automatic generation of code to record simulation data and visualisation/analysis of data in neuroConstruct
* Recorded simulation runs can be viewed and managed through the Simulation Browser interface
* A Python based scripting interface can be used to control model generation and execution, allowing multiple simulations to be run for cell and network model optimisation

Скачать  Размер: 50 Mb

    Новые программы

  • Программа для создания онлайн тестов, онлайн книг и учебников, проведения тестирования и создания отчетов по результатам тестирования. Может быть использована в качестве системы дистанционного обучения. Легко адаптируется под дизайн вашего сайта.
  • Онлайн переводчик Gtext translator автоматически соединяет вас с Translate.Google! Для этого вам достаточно выделить нужное слово или даже фразу, легким движением руки нажать на «горячую клавишу»
  • Простая и добная программа - сборник принципиальных схем по радиоэлектронике. Более 300 схем удобно рассортированы по категориям с удобной навигацией. Сборник будет интересен и полезен для радиолюбителей и тех кто интересуется радиоэлектроникой.
  • Learn the 21 notes of the Bass Clef and Treble Clef. The program displays the notes on the staff, and you press the name of the letter. If you get it wrong, the program displays the name above the staff. You then press the correct name to proceed.
  • Chinese Tales and Fables is an illustrated e-book with Chinese art and enhanced with Chinese classical music. Each fable is a brief story, contained on a single page with an implied common-sense moral.
  • Многоканальный Анализатор спектра реального времени, осциллограф, частотомер, фазометр, вольтметр постоянного и переменного тока, измеритель шумов и нелинейных искажений, мощности, плотности амплитудного распределения входного сигнала.
  • My Print Jobs глобальный каталог индустрии печати RSS-каналы Принт является ведущим информации веб-сайт полиграфической промышленности и производства и продажи полиграфическая промышленность устройства. Полезно для профессионалов
  • Многофунциональная электронная реализация периодической системы Менделеева. Содержит исчерпывающую информацию о каждом химическом элементе. Мгновенно уравнивает химические реакции любой сложности. Включает химический калькулятор и ряд других функций
  • JPKD is a computer program designed for clinical pharmacokinetic services (or TDM). It not only inherits all functionalities of mobilePK, but also has a built- in algorithm of user's defined Bayesian model for individualized pharmacokinetic.
  • A PDF search tool or PDF search engine for searchable PDF files collection with extraordinary search options and aids article review process. It provides special search options, full result management and exporting capability.